MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160

Total Repeats: 5226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007426	AAGG	2	8	1132	1139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007426	TCT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007426	GTCG	2	8	1238	1245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007426	CAC	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007426	CCG	2	6	1886	1891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007426	CCA	2	6	1911	1916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007426	GCG	2	6	1917	1922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007426	CGC	2	6	3872	3877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007426	CGC	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007426	GCG	2	6	5241	5246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007426	CTC	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007426	CCGGA	2	10	6321	6330	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007426	TCG	2	6	6351	6356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007426	CGACC	2	10	6376	6385	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_007426	GCC	3	9	6415	6423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007426	GC	3	6	8746	8751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007426	TA	3	6	9997	10002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007426	CCGG	2	8	10035	10042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007426	GTC	2	6	10754	10759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007426	TCT	2	6	11407	11412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007426	GAT	2	6	11453	11458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007426	GAT	2	6	14334	14339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007426	GTC	2	6	14343	14348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007426	CCG	2	6	14910	14915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007426	ACGG	2	8	14959	14966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007426	CCG	2	6	14967	14972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007426	CGA	2	6	16533	16538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007426	GGC	2	6	16541	16546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007426	TCA	2	6	18874	18879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007426	CAG	2	6	19354	19359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007426	GTG	2	6	19432	19437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007426	GCC	3	9	19689	19697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_007426	CGG	2	6	20884	20889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007426	GAAC	2	8	22558	22565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007426	ATT	2	6	22633	22638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007426	CGG	2	6	22673	22678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007426	CAA	2	6	22704	22709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007426	GTTC	2	8	23210	23217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007426	AGC	2	6	23239	23244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007426	GCA	2	6	23509	23514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007426	TAG	2	6	25043	25048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007426	CT	3	6	25049	25054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007426	AT	3	6	25060	25065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007426	GT	3	6	25095	25100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007426	CGG	2	6	26451	26456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007426	CGT	2	6	28226	28231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007426	GGC	2	6	28237	28242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007426	CAG	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007426	AACA	2	8	28882	28889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007426	AGGG	2	8	28958	28965	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007426	GAC	2	6	29961	29966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007426	A	6	6	31500	31505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007426	GTC	2	6	32912	32917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007426	TGC	2	6	32947	32952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007426	C	6	6	33008	33013	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_007426	GCG	2	6	33485	33490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007426	AG	3	6	33517	33522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007426	CTT	2	6	34463	34468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007426	CGG	2	6	34500	34505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007426	CAG	2	6	35948	35953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007426	CGC	2	6	35965	35970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007426	CGT	2	6	36006	36011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007426	ATT	2	6	36017	36022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007426	AGT	2	6	36061	36066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007426	GCCA	2	8	36101	36108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007426	GCC	2	6	36172	36177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007426	CGA	2	6	39174	39179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007426	GGT	2	6	39806	39811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007426	CAG	2	6	39851	39856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007426	CG	3	6	40036	40041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007426	TCGG	2	8	40079	40086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007426	ACG	2	6	40101	40106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007426	ACGG	2	8	40135	40142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007426	CTGG	2	8	41552	41559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007426	AAC	2	6	41593	41598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007426	ACC	2	6	44677	44682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007426	CGG	2	6	44702	44707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007426	GCCG	3	12	46182	46193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007426	GCG	2	6	47012	47017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007426	AG	3	6	47083	47088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007426	AGC	2	6	47095	47100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007426	GGC	2	6	47117	47122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007426	GTA	2	6	47183	47188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007426	CTT	2	6	47200	47205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007426	G	6	6	58118	58123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007426	CGC	2	6	61405	61410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007426	GGC	2	6	61431	61436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007426	GGA	2	6	61448	61453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007426	CGG	2	6	63734	63739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007426	GTCG	2	8	63742	63749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007426	GT	3	6	63772	63777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007426	CGC	2	6	63785	63790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007426	TTC	2	6	63795	63800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007426	CGA	2	6	63813	63818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007426	CAC	3	9	63824	63832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007426	GCC	2	6	63847	63852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007426	GGA	2	6	66581	66586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007426	AGA	2	6	66615	66620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007426	GTA	2	6	69226	69231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007426	CGA	2	6	69252	69257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007426	TCGG	2	8	72876	72883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007426	ACC	2	6	73444	73449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007426	GCC	2	6	73465	73470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007426	GGC	2	6	73483	73488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007426	GCG	2	6	78169	78174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007426	CGT	2	6	80368	80373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007426	GCG	2	6	80410	80415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007426	TCA	2	6	80430	80435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007426	CAG	2	6	86533	86538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007426	CGT	2	6	86540	86545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007426	TCG	2	6	86554	86559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007426	ATA	3	9	87970	87978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007426	TA	3	6	88004	88009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007426	GAAAG	2	10	88722	88731	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007426	GGT	2	6	88746	88751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007426	TTC	2	6	88763	88768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007426	GTC	2	6	92264	92269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007426	ACG	2	6	92282	92287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007426	CGG	2	6	96247	96252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007426	CGGG	2	8	96255	96262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007426	AGG	2	6	96265	96270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007426	GCC	2	6	97387	97392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007426	CGGGT	2	10	99675	99684	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007426	G	6	6	99689	99694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007426	GTG	2	6	99704	99709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007426	GCC	2	6	99715	99720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_007426	CGG	2	6	99723	99728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007426	TGG	2	6	104596	104601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007426	AGT	2	6	105123	105128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007426	GTC	2	6	105172	105177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007426	CGA	2	6	105180	105185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007426	GTG	2	6	108667	108672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007426	CCCG	2	8	109138	109145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_007426	GGC	2	6	109168	109173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007426	CGT	2	6	109184	109189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007426	GCA	2	6	109873	109878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007426	ACC	2	6	109892	109897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007426	AGA	2	6	109898	109903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007426	T	6	6	111991	111996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007426	ACC	2	6	111997	112002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007426	GT	3	6	114477	114482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007426	GTTC	2	8	114489	114496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007426	TAA	2	6	114531	114536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_007426	CGC	2	6	116510	116515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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275	NC_007426	GCC	2	6	178618	178623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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277	NC_007426	CCG	2	6	181744	181749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_007426	CCG	2	6	182265	182270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_007426	AG	3	6	183980	183985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_007426	CGT	2	6	188331	188336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_007426	CGGC	2	8	188349	188356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_007426	C	6	6	188392	188397	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
284	NC_007426	AC	3	6	188419	188424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
285	NC_007426	AT	3	6	188425	188430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007426	GGAAT	2	10	188435	188444	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
287	NC_007426	TGAG	2	8	188447	188454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
288	NC_007426	GTTTCC	2	12	188458	188469	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_007426	AAC	2	6	188910	188915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_007426	ACCG	2	8	188952	188959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
291	NC_007426	GGA	2	6	191913	191918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_007426	GCG	2	6	192001	192006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_007426	AGC	2	6	192044	192049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_007426	ACC	2	6	192054	192059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_007426	TCGGCA	2	12	193573	193584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_007426	GAG	2	6	193599	193604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
297	NC_007426	GTG	2	6	193656	193661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_007426	CGT	2	6	193666	193671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_007426	TG	4	8	193672	193679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
300	NC_007426	ACG	2	6	193685	193690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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303	NC_007426	CTC	2	6	193761	193766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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305	NC_007426	GGT	2	6	195351	195356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_007426	GCG	2	6	195380	195385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
308	NC_007426	ACCGCG	2	12	195386	195397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
309	NC_007426	CGG	2	6	195408	195413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_007426	ACG	2	6	195619	195624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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314	NC_007426	CGG	2	6	197553	197558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
315	NC_007426	CCG	2	6	197560	197565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
316	NC_007426	GGT	2	6	197588	197593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
317	NC_007426	CCG	2	6	198954	198959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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321	NC_007426	CTC	2	6	201313	201318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
322	NC_007426	CAT	2	6	201372	201377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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324	NC_007426	G	6	6	202925	202930	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_007426	GTC	2	6	203228	203233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_007426	CTCG	2	8	212618	212625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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399	NC_007426	CGG	2	6	213363	213368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_007426	TGC	2	6	213378	213383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_007426	CAAA	2	8	213433	213440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
402	NC_007426	ACG	2	6	213470	213475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_007426	CTG	2	6	213797	213802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_007426	AGTC	2	8	213808	213815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
405	NC_007426	CTA	2	6	213908	213913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_007426	TCG	2	6	214038	214043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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408	NC_007426	CA	3	6	214162	214167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
409	NC_007426	TG	3	6	214183	214188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
410	NC_007426	GTG	2	6	214218	214223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
411	NC_007426	TTC	2	6	214230	214235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_007426	TCC	2	6	214325	214330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_007426	AGG	2	6	214337	214342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
414	NC_007426	TCGG	2	8	214394	214401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
415	NC_007426	AGG	2	6	214463	214468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_007426	CG	3	6	214617	214622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
418	NC_007426	TAC	2	6	214638	214643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_007426	CG	3	6	216771	216776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
452	NC_007426	CG	3	6	216802	216807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
453	NC_007426	CTG	2	6	216843	216848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_007426	TG	3	6	217320	217325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_007426	CG	3	6	217382	217387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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